故事开启之前的剧情，最早可以追溯到远古时期，随后数千年的时间里，各种事件陆陆续续发生，影响着这个世界。八方旅人的故事也逐渐展开了……
【远古时期】
世界有十三神，其中8个神对应的是游戏中八个起始职业，有四个神对应的是隐藏职业，最后一个神是黑暗之神加尔德拉。
【数千年前】
十二神（除黑暗神外）将“被视为禁忌的”生与死的力量（也被称作“黄金的果实”）封印了起来，并建造了菲尼斯之门，以防这种力量外泄。而打开菲尼斯之门的唯一手段，就是利用龙之石的力量。在西北方村落（猎人的故乡）的远古遗迹内，留下了相关记载的壁画。而记录这件事的《边狱之书》原典则是外流出去，若干年后成为了东方某国贵族学院的藏书。
【200年前】
大魔法师奥尔金·克罗斯福德联手霍伦布尔格国王贝奥武夫，利用四块龙之石的力量把黑暗之神加尔德拉封印在了菲尼斯之门内，并用圣火加固封印。
封印成功后，霍伦布尔格王将龙石托付给了最信任的骑士初代雷瓦斯，让他前往遥远的西方代代守护；随后，他创立了圣火教会，每20年发起一次传火巡礼，用于加固圣火的封印（圣火会每隔20年会衰弱，所以需要传火来让它重新变强）。
【100年前】
圣火教会有一个中二教徒马蒂亚斯，在目睹一个村庄被雷击引燃的大火毁灭后，想通过祈祷引发奇迹，然而祈祷一个月之后，什么都没有发生，就信仰崩溃叛离了圣火教会，潜伏了起来。
【约50年前】
有一个自称黑暗神女儿的名为莉普拉库的魔女，开始到处活动，她手持记载了禁忌力量使用方法的《边狱之书》，诱骗当时正被通缉中的“中二叛徒前圣火骑士”马蒂亚斯，使用书上的黑咒术，利用菲尼斯之门外流出的黑火，获得了所谓的“永生”。
【35年前】
（战士线主角）欧贝里克诞生。
【30年前】
（学者线主角）塞拉斯诞生。
【26年前】
（猎人线主角）汉伊特诞生。
【23年前】
（舞娘线主角）普丽姆萝丝诞生。
【22年前】
（盗贼线主角）提里昂诞生。
【21年前】
（药师线主角）阿芬诞生。
【20年多前】
霍伦布尔格王国佣兵维尔纳被莉普拉库委托：毁灭霍伦布尔格王国。由于他提供了大量的金钱和人脉作为筹码，维尔纳毫不犹豫的接受了委托。他先收买了大量佣兵结成佣兵团，然后开始收集霍伦布尔格王国的情报，逐步排除障碍。
【20年前】
（神官线主角）奥菲利亚诞生。
【18年前】
（商人线主角）特蕾纱诞生。
【17年前】
维尔纳以自导自演的方式操纵自己收买的佣兵团“打败”同样由他收买来进攻王国边境的“山贼团”，借此获得了战功，并以此赢得了国王的信任。之后，“捡到”了边境被袭击的某山村幸存者埃尔哈特。
之后，利用金钱作为支持，维尔纳开始逐步腐化霍伦布尔格王国的重臣，渐渐让霍伦布尔格国王失去民心，降低国家军队的战斗力，以及树立自己的权威，一步步向上爬。
同一时间段里，马蒂亚斯更名改性，重新潜入圣火教会，利用金钱和人脉关系，他获得了尤瑟夫主教的赏识，占据了教会的一席之地。而为了腐化教会，他和中二贵族席缅（舞者线最终BOSS）一起组建了一个集暗杀、筹钱和腐化于一体的组织：黑曜会。
【约15年前】
霍伦布尔格王国边境的战乱也导致了奥菲利亚的家乡被毁，孤苦伶仃的她被圣火教会的尤瑟夫大主教领养，作为圣女莉雅娜的玩伴，一同学习和生活。
【15年前】
贵族学院的学者伊文得知了《边狱之书》原典的消息：就在学院的特别书库里，然而当时这个书库中的书只有校长才能翻阅。后来，他的学生露西亚为他带来了一个可以帮助他的女人——莉普拉库。
莉普拉库谎称《边狱之书》是传说时代贤者所写的书，里面拥有着能让人超脱生与死的力量。而她来的目的，就是为了让伊文来解读这本书的知识，而不是“没有能力”的校长。至于方式，就是通过（黑曜会）暗杀掉校长，让他坐上校长的位置。
他们的计划成功了：前校长“失踪”；伊文顺利坐上了校长的位置；也获得了《边狱之书》原典（对外声称失窃）；而露西亚则作为他助手，一边帮莉普拉库传递消息，一边帮助伊文进行解读。
为了能让伊文更快解读《边狱之书》，露西亚经常给伊文提供大量稀有的参考书籍（从莉普拉库那里获得）。
【约十几年前】
青年学者塞拉斯成为贵族学院的老师。
【10年前】
杰佛里·埃塞尔特死于黑曜会三个有乌鸦纹身者的暗杀。原因是由于杰佛里领主并不与黑曜会同流合污，并且调查出了黑曜会的最终目的是菲尼斯之门的事，因此，黑曜会必须杀他灭口。而暗杀当晚，杰佛里的女儿普丽姆萝丝躲在书柜后面，偷看到了暗杀的全过程。三人离开后，普丽姆萝丝带着父亲的短剑，偷偷跟踪凶手，也离开了故乡。
同年，和塞拉斯结下深厚友谊的学院女学者奥德特遭人诬陷，被赶出了学院。
同一时期，已经身处霍伦布尔格王国高位的维尔纳，把埃尔哈特推荐给了霍伦布尔格国王作为近卫骑士。实际上，埃尔哈特是维尔纳埋下的间谍，为了在关键时刻发挥作用。而埃尔哈特把曾经边境山村毁灭的这件事都归责给了国王，原因是直到村庄毁灭，都没有得到王国的支援。然而他并不知道，村庄的毁灭实际上是维尔纳一手造成的。
【8年前】
维尔纳在身处高位之后故技重施，雇佣了大量山贼向霍伦布尔格王国进攻，在关键的一战中，埃尔哈特当着回来报告战况的将军欧贝里克的面，杀死了霍伦布尔格国王，直接导致了王国军的战败，并进而使得霍伦布尔格王国毁灭。由此，菲尼斯之门再无人守护。
【霍伦布尔格王国毁灭后】
旅行药师格拉姆·克罗斯福德为了治疗身患重病的妻子，环游世界寻找药物。在寻找最为关键的一种素材时（一种生存在海外森林中的鸟的羽毛），遇到了商人船长莱昂·巴斯特雷尔，作为上船的代价，他留下了周游世界时所写下的旅行笔记。
然而，就在特效药完成前的几天，格拉姆的妻子却死去了。虽然最终完成了特效药，但却已经毫无用处。在妻子葬礼之后，莉普拉库突然来找他，告诉他她可以让他再次见到妻子。只要前往菲尼斯之门，他就可以和他的妻子再相会。
于是，格拉姆再次朝向东南方旅行。在途径某个山村时，他遇到了一个患上和他妻子完全相同病症的孩子阿芬，出于对妻子的思念，格拉姆把之前做好的特效药给了这个孩子使用，让他保住了性命。少年阿芬由此立下了成为药师的梦想。
之后，格拉姆再次出发，终于赶到了菲尼斯之门。莉普拉库说能让他的妻子复活，让他站在魔法阵中，进行了一个魔法仪式。而实际上，这个仪式并不能让他的妻子复活，而是要把格拉姆变成黑暗神降临的肉身载体。
作为封印黑暗之神加尔德拉的大魔法师奥尔金·克罗斯福德的后代，格拉姆也拥有着封印者的血脉。如果他逃了，莉普拉库就会去找他的儿子克里斯·克罗斯福德来完成这个仪式。依靠着仅存的一丝意识，已经基本变成怪物的格拉姆释放出最后一击，打伤了莉普拉库，同时也打断了仪式，尽管格拉姆想断绝祸根，追上并杀死莉普拉库，但逐渐丢失的意识却让他最终却没能完成这件事，只能遵从于本能的从菲尼斯之门逃了出去。
逃离菲尼斯之门后，格拉姆在各地流浪，渐渐别黑暗的力量所同化，最终失去了人性，变成了一个双目赤红并且能让生命变成石头的怪物。
【几年前】
青年盗贼提里昂遭到了搭档达留斯的背叛，被踢下了山崖，但大难不死，开始在世界中旅行。
【一年前】
猎人汉伊特的师傅接受了骑士伊莉莎的狩猎委托（目标是一只代号为“赤目”的怪物）后失踪。
同一时期，经过十余年的研究，伊文已经解开了《边狱之书》的部分内容，发现这是关于生与死的力量。助手露西亚利用研究成果，开始策动手下到边远地区，尝试以大量人的血为素材，来制作据说可以使人超脱生死的结晶——血晶石。
伊文校长是一个喜欢独占知识的学者，在他研究期间偷偷把大量与此有关的珍贵文献悄悄偷出特别书库，就是怕知识的外泄。而其他特别书库的书，他也不愿意把那些知识传出学院以外。这一点上，他和学者塞拉斯在立场上是完全对立的。
【如今】
八方旅人的故事由此开始。
