画面回到第一章结尾，夏目向主角说明一切后邀请他加入妖怪侦探团，虽然剧情有点惊吓但是为了拯救世界主角加入了。由于到了未来世界，所以原来的妖怪徽章也变了样子（成了钥匙状，地缚猫吐槽自己种族的心心不见了），为了验证新的徽章能不能召唤，主角演示一下发现地缚猫的种族都变了，不过无论变成什么种族召唤还是以前一样就好了。接下来可以调查附近的妖怪，首先前往侦探团本部-アキノリ的房子（穿过サクラギビルズ的那头一个叫香住台的地方）。
跟着提示来到香住台アキノリ的房子，原来这里就是妖怪侦探团事务所，接着アキノリ的奶奶进来（等下，自行车是借给这位老奶奶？）跟大家打招呼，知道主角是从过去来的，アキノリ想让主角回去之前都在这里住下，奶奶也很乐意答应了（奶奶说：当作自己家就好了）。另外怎么从未来打开那扇门，奶奶也在调查，如果有什么消息会通知アキノリ。
奶奶走后大家商议，既然主角住的地方定了下来，接着该调查怪奇事件了。アキノリ在网上查了下，接下来的怪奇事件都是在半夜发生的，要半夜出门被家人知道可不行（主角以为未来的自己会允许女儿半夜出门，其实根本不行）。这时主角想起在前代用过的办法，利用バク制造一个假的自己留在家里睡觉，大家认可这个方案后决定先回夏目家。
夏目带着バク回到家里，上楼调查床以后バク出来解释怎么让爸妈不知道自己半夜出门（变成夏目的样子睡觉），但是要先设置好起床时间才能睡哦。另外由于バク除了食梦以外还会吃掉人的疲劳，所以即使夏目晚上出去第二天也不会困的。再次调查床，选择第三项设置起床时间为0点（明日午前0点）然后选“はい”就行。接着半夜起来，バク变成自己的样子，家里人都睡了，向公园出发吧。
来到公园发生剧情，伙伴们都觉得主角能和バク成为伙伴不愧是传说中的手表使用者，接着开始调查怪奇事件（夏目身上好像有奇怪的光但主角怀疑自己看错了）。接下来的怪气事件可以在侦探事务所的电脑上或者任务菜单接受委托。
1、真夜中の果たし状
第一个事件，跟着提示来到目的地后得知男子听到附近有声音“来决斗吧”，但是又看不到人，用手表扫描看看。
扫描后找到一扇不可思议的门，声音是从里面传出的。正在想怎么开门时，后面的男孩把附近捡到的钥匙交了出来（男孩胆子够大的）。
开门后来到一个异世界，这门是アークのトビラ，可以进入里世界，而且这里的妖怪都非常凶暴，所以要特别小心（以后获得各种 钥匙后来到这个门前调查可以选择不同的钥匙进入，比如会有某些钥匙是某个种族的进去则只会遇到某个种族，还有特殊的钥匙等等）。
