支线只有三个：妖之恋、黑曜、心愿，其余全为小任务，小任务一共有十五个。其中支线全部是在正确的时机到某一个特定地方会自动触发的，而且支线全部没有奖励，只是丰富了故事的内容；小任务是需要跟相应的人对话才可以触发的，而且完成任务都有一定的奖励。
现将古剑奇谭所有的支线任务按照第一次触发的城镇排序，整理如下（有些细节还是不完整期待各位补充o(∩_∩)o ~）
琴川
知恩图报
任务奖励：舒筋定痛散×5 养心丹×3 帝女玄霜×2
Ⅰ.琴川
进入琴川后，到琴川彩船旁，与邱婆婆对话
Ⅱ.江都
到达江都后与南边出城口的附近的阿里•代伊对话
注：完成任务时身上需要有5个丹桂花糕，但完成任务只会消耗一个丹桂花糕。
最好不要把邱婆婆给丹桂花糕全部用掉，需要留桂花糕完成任务
在虞山•珍珠滩末尾可买到丹桂花糕食谱(合成需稻米×1 丹桂×2 蜜糖×1，种桂花可得丹桂和蜜糖)
