MuvLuv Alternative 2001年10月22日。白银武突然在一个不曾见过的世界中醒了过来。这里是地球人与地球外起源种“BETA”进行着关乎地球人的生死存亡的战斗的平行世界。武在这个世界中加入了为了拯救人类而制订的“ALTERNATIVE4”计划，并做为一名国联军卫士进行战斗。但是，国家之间无法克服利害问题的人类却决定选择放弃地球的“ALTERNATIVE5”计划……3年后，从沉眠中醒来的武再次回到了进入“平行世界”的那一天。这次，他将以完成“ALTERNATIVE4”为最终目的。