2、阶段
双方玩家交替进行回合，每个回合分为6个阶段，按右键就可以切换阶段。
DP：抽牌阶段。正常抽一张卡，无卡可抽也算输。（有些卡牌效果会阻止抽卡或者额外抽卡）
SP：准备阶段，很多卡牌效果指定在这个阶段生效。
MP1：第一个主阶段，玩家可以在主阶段使用卡牌、调整怪兽、或是使用怪兽、场地效果。
BP：战斗阶段，控制怪兽作战。
MP2：第二个主阶段，作用和mp1一致，通常时根据战斗结果和下回合策略安排一些应对。
EP：回合结束阶段，很多卡牌效果指定在这个阶段生效。
场地中心高亮处的文字也会显示当前的阶段。
如果玩家完成了一个阶段的操作，可以右键选择下阶段进行。
一般来说，可能会在战斗阶段生效的陷阱、怪兽卡都在主阶段1使用。
同样，能够对战斗阶段产生优化的卡牌（例如去除敌人、清理对方魔法陷阱等）也在主阶段1使用。
主阶段2更多的是进行调整和针对对手的回合进行布置。
举例来说，怪兽箱的效果就是在准备阶段发动。
玩家如果不能支付500生命则会摧毁怪兽箱。
必须要先处理完这些效果和选择，才能进入下一个阶段。
多数非永续也非即时结算的卡牌效果只能持续的回合结束。
例如洗脑，该回合生效，回合结束时失效。
或者有些卡牌也会在回合结束时产生效果，同样必须处理或者选择后才能轮到对手回合。
