★第三十一话 ブ－ビ－·トラッブ/傻瓜圈套（超级系）
★第三十一话 奇迹の价值は/奇迹的价值（真实系）
基本上两分支在剧情上是相同的，只是战斗时敌我双方机体配置有所不同。这一关的目的是保护MACROSS不让敌人接近并将敌人全灭，虽然因为敌人众多而有些紧张，不过首次登场的MACROSS那些战斗机“女武神”是非常厉害的。除了装甲低的缺点以外，其移动力、运动性很高，而且各个都有地图炮。另外需注意的是，这一关以及下一关都不能让所有机体一拥而上，因为敌人会出现增援，需要留一些人守侯在基地附近。待敌人全灭后，基雷亦向南亚塔利亚岛发动攻击，原先准备好的令R-GUN回击或让EVA张开绝对领域防御都没能派上用场，MACROSS居然自己变形并用主炮反击。古洛巴尔方醒悟此乃过去异星人在MACROSS上设置的开关。
★第三十二话 カウント·ダウン/倒数（超级系）
★第三十二话 スペ－ス·フォ－ルド/太空折叠（真实系）
因为敌人的目标是MACROSS，所以古洛巴尔决定利用太空折叠，让MACROSS升上太空。所以本话的主要目的就是保护MACROSS，支撑到它升空为止。这一关的敌人非常多，几乎打到手酸。而且敌人主要从左、右、下三个方向过来，只要消灭一个队伍就会有另一队伍登场，所以必须在MACROSS的三个方位都配置机体，并且每个方向都不能把机体全部放出去迎击敌人，而是应该留两台以防不测，否则只要敌人走进基地就算输了。
★第三十三话 トランス·フォ－メ－ション/变形（超级系）
★第三十三话 ア－ムド·アタック/手臂攻击（真实系）
MACROSS使用了太空折叠后，虽然成功地来到了太空，但却是在太阳系最远的星球冥王星附近，而且还连周围的东西也全部带过去了。刚刚收容完毕后，天顶星人又追过来了。因为这些敌人的船舰有着极高的HP，且增援不断。乍看似乎有难度，其实这只是个走过场的剧情。首先敌人在右下方那一大堆皮糙肉厚的战舰是不会动的，没有必要去理睬他们，而且只要坚持到5回合后MACROSS就会变形过版。大家只要抓紧时间多多杀敌抢经验值即可，但要注意的是到了第5回合，我方机体必须全部移动至MACROSS的后面或与它并列，否则是会一炮打进的。
★第三十四话 隐された杀意/隐藏的杀意（超级系）
英格拉姆提出要SRX小队的3人进行合体训练，隆圣听了非常高兴，他一直盼望着能驾驶超级机器人。彩却对此没有信心，不过受到她一直暗恋的英格拉姆的鼓励后，终于还是下定了决心。主角跟着SRX小队一同前去训练，可惜最后合体还是失败了，彩还因为受到精神感应的强烈冲击昏厥过去。就在这时，帝国指挥官蕾比·托拉与夏比洛来袭。眼见隆圣他们没有想预料中那样觉醒超能力的力量，英格拉姆终于露出他的真面目，原来他竟是异星人派来当卧底的！紧接着，英格拉姆更将彩的R-3给击坠了！众人大怒，遂开始反击。要打倒英格拉姆和夏比洛并非难事，只要动用大量的精神力来辅助即可。蕾比的玖狄卡就非常困难，最佳方法是让隆圣去攻击她，这样蕾比会因隆圣的精神感应而头痛不已，最后更会离开战场。接着加戈尔出现并放出新的合金兽，还扬言已破解了V型电磁侠的招式。不过在蕾比的命令下，还没等他发挥能力就强制撤退了。
待敌人离去后，众人找到了R-3的残骸，彩虽侥幸拣回条命但却负了重伤。隆圣亦受到很大的打击，他万万没有想到自己所信赖的教官会背叛他们（此时选第二项能提高熟练度）。
★第三十四话 天敌との遭遇/与天敌相遇（真实系）
镜头又转到EXCELION那里，他们还在与宇宙怪兽作战，田代舰长决定用亚空间航法逃脱宇宙怪兽的追击。这一战的敌人其实并不很强，与天顶星人一样，宇宙怪兽中的一般兵很弱，船舰型也只是HP高以及能回复HP而已，即没有非常强力的武器也没有很高的运动性能，它们最擅长的是人海战。第三回合时，MACROSS就会前来增援，此时应能轻松地应付过关。
★第三十五话 サタン·ファイト/土星之战（超级系）
MACROSS来到土星附近，天顶星人又追了上来，不过这次的敌人大多是些小兵，不足为惧。当首批敌人全灭后，又有敌增援在右下方出现，更有敌人入侵至MACROSS内，此时要一条辉选择是去追击抑或等待增援。选前者（第一项）的话是可以提升熟练度的，但就会马上结束这一版面，或者的话虽没有熟练度却能将所有敌人消灭的机会，要熟练度还是要经验值，全在大家自己。
★第三十五话 イングラムの真意/英格拉姆的真意（真实系）
这一话与超级系的第三十四话“隐藏的杀意”基本相似，只是味方增援人物有些不一样而已。
